Вологодский районный суд Вологодской области был образован в январе 1930 года и назывался Вологодским районным народным судом.

  Организациями-предшественниками являлись народные суды по двум участкам Вологодского уезда. В состав суда входили мировой судья, заседатели, секретарь суда, письмоводитель, сторож. В 1917 действовало уже 5 судебных участков Вологодского уезда: в городах Вологде и Соколе, селах Кубенское, Нестерово, Новленское, - а с 1926 года - 9 судебных участков Вологодского уезда: по 2 в г. Вологде и г. Соколе, по 1-му в с. Кубенское, с. Шоломово, п. Чебсара, с. Сидорово, с. Святогорье. 

В январе 1930 года был образован Вологодский районный народный суд. 

За время своего существования Вологодский районный суд сменил не один адрес. Был в его истории и пожар.

В ночь с 08 на 09 февраля 2004 года сгорело здание Вологодского районного суда, расположенное по адресу: г. Вологда, Советский пр., д. 103. Специалистами Управления государственной противопожарной службы установлено, что причиной пожара был  поджог. На месте происшествия обнаружены три 10-литровые канистры из-под бензина. Во время тушения огня пожарным удалось эвакуировать судебные архивы, здание суда восстановлению не подлежало.

  В июле 2004 года Вологодский районный суд переезжает на второй этаж административно-хозяйственного корпуса Льнокомбината по адресу: г. Вологда, Советский пр., д. 139, - где и располагается по настоящее время. В период с 1943 по 1948 годы в здании находилось Шестое отделение лагеря № 158 ГУПВИ НКВД СССР, в котором содержались военнопленные, отличавшиеся интернациональным составом: помимо немцев, здесь содержались финны, итальянцы, венгры, испанцы. 

  С 1963 по 2024 годы председателями Вологодского районного народного суда и Вологодского районного суда были     Ковалев М.Н. , Буликов И.Д., Барсуков С.И., Грабежев В.А., Сысоев А.А., Суровцев Л.А., Пеклецова Т.П., Мякина М.Л., Додул А.И., Бондаренко Е.В.   

Судьями: Барсуков С.И., Мищенко Т.Д., Матеров Н.В., Сысоев А.А., Зубова Т.С., Печурина Н.А.. Пеклецова Т.П., Мякина М.Л., Попаденко М.В., Кузьмин А.А., Зимин В.А., Тихонюк Т.Л., Тарасюк С.А., Коновалова Н.Б., Шмаков Н.Н., Лукьянова И.Б., Скороходова А.А.

Организациями, обеспечивающими деятельность суда, последовательно являлись Вологодский губернский отдел юстиции, Управление НКЮ РСФСР и СССР по Вологодской области, Отдел юстиции Вологодского облисполкома, Управление Министерства юстиции РФ по Вологодской области. С 1998 год и по настоящий момент – Управление Судебного департамента в Вологодской области.

  С августа 2025 г. по настоящее время председателем Вологодского районного суда Вологодской области является Жукова Светлана Юрьевна. Дела, отнесенные к юрисдикции суда, рассматривают судьи: Мокиевская Светлана Николаевна, Гвоздева Наталия Владимировна, Тихонюк Тамара Леонидовна, Другов Дмитрий Николаевич,   Лутошкина Ольга Михайловна, Григорова Светлана Геннадьевна, Тарасюк Светлана Аркадьевна.

Своевременному осуществлению правосудия способствует качественная и оперативная деятельность работников аппарата суда. Штатная численность работников аппарата суда составляет   28 человек: два начальника отдела, помощник председателя суда, два заместителя начальника отдела, семь помощников судей, девять секретарей судебных заседаний, один консультант, три главных специалиста,  один ведущий специалист, два старших специалиста 1 разряда. 24 работника аппарата суда имеют высшее юридическое образование, один старший специалист 1 разряда в настоящее время такое образование получает.

   Вологодский районный суд занимает третье место по области среди городских и районных судов по количеству рассматриваемых дел. В 2025 году судом рассмотрено 4557 дел и материалов.